Функция выводов PA6, PA8, PA9 может быть изменена, но необходимо, чтобы выводы работали на вход: согласно спецификации, порты PA6, PA8, PA9 должны быть настроены на вход и не должны настраиваться на выход регистром PORTx_OE при использовании отладочного интерфейса JTAG.
Вывод PA7 при настройке в функцию TMR1_CH4N и соответствующей настройке таймера 1 на выход ШИМ в канал CH4N перестает функционировать как TDO. Работа отладочного интерфейса при этом будет нарушена - выводимый сигнал TDO и TMR1_CH4N объединяется на выводе PA7 по логическому ИЛИ. Помимо этого, вывод PA7 работает на выход всегда, когда разрешена работа отладочного интерфейса JTAG.
С ревизии 2 вывод PA7 может работать в качестве TMR1_CH4N только при запрещенной работе отладочного интерфейса. При разрешенной работе отладочного интерфейса функционирует как TDO.